Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC134Q9H6E4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC134Q9H6E4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms