Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIPK3Q9H422 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms