Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD3Q9H3P7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACBD3Q9H3P7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms