Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms