Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CADM1Q9BY67 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CADM1Q9BY67 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms