Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRTQ9BXP5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms