Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI2

SLC25A2, Mitochondrial ornithine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A2Q9BXI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC25A2Q9BXI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A2Q9BXI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms