Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL3Q9BXA9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms