Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM2Q9BVW6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms