Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP58Q9BVL2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms