Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRNP25Q9BV90 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms