Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms