Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms