Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX2Q99811 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX2Q99811 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX2Q99811 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRRX2Q99811 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX2Q99811 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX2Q99811 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms