Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1Q99536 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAT1Q99536 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms