Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD1Q99460 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD1Q99460 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms