Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD11Q96NU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms