Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNBD2Q96M20 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNBD2Q96M20 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms