Protein–RNA interactions for Protein: Q96LK0

CEP19, Centrosomal protein of 19 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP19Q96LK0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP19Q96LK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP19Q96LK0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms