Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms