Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms