Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZC2HC1AQ96GY0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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