Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF185Q96GF1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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RNF185Q96GF1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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