Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39LQ96EH5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms