Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO17Q96EF6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms