Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms