Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTP4Q96DX8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms