Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NMD3Q96D46 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMD3Q96D46 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms