Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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FAM3DQ96BQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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