Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP13Q92995 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP13Q92995 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP13Q92995 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms