Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLP1Q92989 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms