Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA6Q92908 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA6Q92908 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms