Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms