Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF4BQ92750 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF4BQ92750 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms