Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1orf54Q8WWF1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf54Q8WWF1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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