Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRIM41Q8WV44 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms