Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC150Q8NCX0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms