Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms