Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL4BQ8N7F7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBL4BQ8N7F7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms