Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC2Q8N158 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC2Q8N158 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms