Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD302Q8IX05 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD302Q8IX05 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms