Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC83Q8IWF9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC83Q8IWF9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms