Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALYREFQ86V81 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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