Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
YTHDF3Q7Z739 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms