Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTOP2Q7RTS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms