Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFVQ71UI9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms