Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND1BQ6P3S1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND1BQ6P3S1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms