Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 BTN2A3P-201ENST00000377662 1836 ntBASIC7.34□□□□□ -1.232e-11■■■■■ 43
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PRPF8Q6P2Q9 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 36.84□□□□□ -1.312e-11■■■■■ 43
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PRPF8Q6P2Q9 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 43
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PRPF8Q6P2Q9 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 25.93□□□□□ -1.465e-8■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 26.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 43
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PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-14■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.287e-38■■■■■ 43
PRPF8Q6P2Q9 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 NAA25-205ENST00000549711 2933 ntTSL 1 (best)4.75□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 NAA25-208ENST00000552527 5815 ntTSL 23.1□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 P4HA1-206ENST00000464310 415 ntTSL 51.33□□□□□ -2.25e-12■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 ANAPC4-210ENST00000510092 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 HSPE1-206ENST00000473395 569 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-84■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 PRKAB1-209ENST00000545870 566 ntTSL 36.19□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-206ENST00000515226 4435 ntTSL 24.96□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-12■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-12■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 PIP4K2A-203ENST00000422321 768 ntTSL 37.75□□□□□ -1.171e-12■■■■■ 42.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX5-208ENST00000475716 715 ntTSL 39.04□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 42.8
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