Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KANK3Q6NY19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KANK3Q6NY19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KANK3Q6NY19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KANK3Q6NY19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms