Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms